Det har gått två år sedan Naruto lämnade för att träna med Jiraiya, och hans första uppdrag skickar honom till den dolda sanden för att hjälpa till att rädda Gaara. När både Gaara och Naruto kommer ansikte mot ansikte med Akasuki tar Sakura sin plats längst fram i kampen för att rädda dem. Med farmor Chiyo vid sin sida måste hon slåss mot Sasori, som kan skapa golems från de odöda. Men farmor Chiyo är också en dockmästare - bara det kan vara Sakuras trådar hon drar i!