Kafka vill städa upp kaiju, men inte bokstavligen! Kommer en plötslig metamorfos att stå i vägen för hans dröm?
Med de högsta kaiju-uppkomsterna i världen är Japan inte främmande för attacker av dödliga monster. Gå in i Japan Defense Force, en militär organisation med uppgift att neutralisera kaiju. Kafka Hibino, en man som städar kaiju-lik, har alltid drömt om att gå med i styrkan. Men när han får en ny chans att uppnå sin barndomsdröm genomgår han en oväntad förvandling. Hur kan han slåss mot kaiju nu när han har blivit det själv?!
Kafka hoppas att en dag hålla sin pakt med sin barndomsvän Mina för att gå med i Japans försvarsstyrka och slåss vid hennes sida. Men medan hon är ute och neutraliserar kaiju som tredje divisionskapten, har Kafka fastnat för att städa upp efterdyningarna av sina strider. När en plötslig regeländring gör Kafka kvalificerad för försvarsstyrkan, bestämmer han sig för att prova på truppen en gång till. Det finns bara ett problem - han har gjort försvarsmaktens neutraliseringslista under kodnamnet Kaiju nr 8.